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西藏农牧学院高原生态研究所关于冷杉心腐病菌多组学联合测序项目公开询价的公告

西藏林芝 全部类型 2024年11月02日
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正文内容

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根据科研需要,我所拟开展1套冷杉心腐病菌多组学联合测序项目,具体测序内容详见附件。现进行公开询价。

一、询价内容

1.转录组样本信息及测序内容

1)样本来源: 冷杉组织 ;

2)样本形式: 组织样品 ;

3)样本数量: 230 个;

4)完成 230 个样本RNA提取;

5)完成 230 个样本的RNA质检;

6)mRNA分离;

7)双链cDNA合成;

8)完成以下表格要求的文库构建和测序量:

文库类型

测序平台

测序方式

建库数

样本个数

单样本平均数据量

数据量单位

真核转录组文库

illumina

PE150

230

230

6.000

Graw data

注:各样本的raw data不低于承诺平均raw data的98%。

2.微生物样本信息及测序内容

1)样本来源: 冷杉内生菌 ;

2)样本形式: 组织样品 ;

3)样本数量: 205 ;

4)提供实验样本的相关详细资料信息(请注意送样样本命名规范,样本名称必须以英文字母开头,命名支持英文字母、数字、下划线,不可使用空格、中划线或NA、NULL等字符);

5)乙方对甲方的实验样本进行检测,确认样本符合要求后开展实验

6)完成 205 个样本 DNA 提取;

7)完成 0 个cDNA的合成(仅限抽提类型为RNA的样本填写);

8)完成 205 个样本的质检;

9)设计 205 个样本PCR扩增引物以及tag序列,引物选择如下:

引物名称

引物类型

F端序列

R端序列

长度

799F_1193R

植物内生细菌

GTGCCAGCMGCCGCGG

GGACTACNVGGGTWTCTAAT

291

ITS1F_ITS2R

真菌ITS

CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA

GCTGCGTTCTTCATCGATGC

350

备注:请确保所使用引物扩增产物长度在300-500bp以内;

10)有扩增条件要求,甲方提供PCR条件如下:

引物名称

样本个数

最低单样本数据量

单位

平均单样本数据量约

单位

测序方式

799F_1193R

205

40000

clean reads

50000

clean reads

PE300

ITS1F_ITS2R

205

40000

clean reads

50000

clean reads

PE300

11)完成 205 个制备PCR扩增和纯化;

12)使用Picogreen染料荧光计对 205 个PCR产物进行定量并均一化混匀;

13)完成 205 个PCR产物的测序(需保证PCR产物大小在300-500bp之间):

3.基因组测序样品信息及测序内容

1)样本来源: 心腐病菌;

2)样本形式: 组织样品 ;

3)样品数量: 15 个;

4)基因组大小估计为: 未知 Mb;

5)GC含量估计为: 未知 %;

6)是否存在质粒或噬菌体及数量:未知

7)是否菌鉴:是,菌鉴样品数:15

8)完成 15 个实验样品基因组DNA的提取和纯化;

9)完成 15 个实验样品基因组DNA质检和定量;

10) 完成以下表格要求的文库构建和测序量

文库类型

测序方式

建库数

样本个数

单样本数据量/测序深度

数据量单位

PE-400文库

PE150

15

15

1.000

G raw data

Pacbio文库

Pacbio

15

15

30X

hifireads-base

备注:①各样本的数据量(clean data) 不低于合同约定的单样本平均数据量(clean data) 的95%

②包Lane测序只保证总数据量,不保证各样本均达到平均测序量。

二、供应商要求

为保证测序质量,对供应商作如下要求:

1.具有独立法人资格。

2.具有类似项目经验,并有良好的业绩。

3.近3年内在经营活动中没有重大违法记录。

三、报价要求

预算金额16万元以内,各供应商在报价时,务必包含以下内容:

1.检测费用:包括测序、运输等费用。

2.服务费用:包括对数据云平台的使用费用。

四、提交材料

请各供应商在报价时,务必提交以下材料(所有材料加盖公章并密封提交):

1.供应商营业执照副本及税务登记证复印件。

2.法定代表人身份证复印件。

3.检测及售后服务方案。

4.报价单(含单价、总价、数量等)。

五、提交时间及地点

提交时间:****中午12:30分前。

提交地点:点击登录查看307办公室,线上请联系后投递邮箱****@126.com。

六、其他说明

1.对符合参数要求的报价采取最低价中标的方式确定供应商,并在3个工作日内与供应商签订合同,非中标供应商不再另行通知。

2.合同签订后,供应商应按照合同约定的时间完成样品的检测工作,并保证样本质检合格后开展检测服务,若不合格应及时联系我方进行补样。

3.供应商应遵守国家法律法规,不得进行任何形式的虚假宣传或贿赂行为。如发现供应商存在违法或违规行为,我方有权取消其参与资格或解除合同,并保留追究法律责任的权利。

4.本项目不接受联合体报价。

5.所有提交的文件均应真实有效,一旦发现虚假或伪造资料,将取消其参与资格或解除合同。

联系电话:****。

附件:冷杉心腐病菌多组学联合测序项目清单

点击登录查看

****

附件:

冷杉心腐病菌多组学联合测序项目清单

序号

各项产品

单项明细

数量

单位

单价

总价

备注

1

微生物组学

冷杉内生微生物多样性分析

205




2

转录组学

冷杉真核转录组测序

230




3

基因组学

心腐病菌基因组测序

15





合计




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